Карта клеточных конденсатов, связанных с онкологическими и неврологическими заболеваниями

Биомолекулярные конденсаты – это подвижные скопления в клетках, упорядочивающие их содержимое путём сгущения молекул ДНК, РНК и белков в важных зонах. Вне зависимости от важной роли эти структуры долгое время оставались загадкой из-за малых размеров, недоступных для обычной микроскопии.

В прошлом конденсаты называли «жидкими», так как некоторые из них сливаются, текут или движутся подобно каплям дождя на стекле. Но расчеты показали, что их внутреннее строение напоминает не жидкость, а сеть, постоянно изменяющуюся во времени, что придает конденсатам свойства, схожие с пластичной массой «лизуна».

Обнаружение и определение местоположения отдельных молекул NR в конденсате. Слева: оценки положения (зелёные крестики) на исходных изображениях. Справа: реконструкция, созданная путём накопления локализаций во времени. Каждая выявленная отдельная молекула представлена красным диском.

Впервые с помощью сверхразрешающей микроскопии и флуорогенов ученые изучили конденсаты с невероятной точностью.

В отличие от существующих методов, которые усредняют данные по всем молекулам, новая технология позволяет следить за отдельными молекулами и их группами. Флуорогены, применяемые по одному, действуют как «маяки», светясь только при контакте с узлами молекулярной сети — зонами, где белки соединяются через «стикеры» — специфические участки взаимодействия.

Благодаря взаимодействиям в белковых последовательностях отдельные белки превращаются в узлы вязкоупругой сети конденсата. Флуорогены светятся только при обнаружении этих узлов, что позволяет наблюдать за их формированием, движением и распадом. Отслеживание отдельного флуорогена исключает помехи от множества одновременных сигналов, свойственных традиционным подходам.

С помощью сверхразрешающего микроскопа учёные обошли дифракционный предел, впервые наглядно показав структуру конденсатов в динамике.

Открытие важно для понимания влияния конденсатов на развитие рака и нейродегенеративных болезней. В этих заболеваниях нарушения их функций критичны. Новый метод позволяет разрабатывать терапии, которые корректируют эти динамичные клеточные структуры.